feat(wave): #119/#122/#131/#132 verts + sprint plugins ESM/persistance #135/#136/#139

État d'intégration confiné à la branche batch. Les tickets #119 (skills →
capacités agent découvrables), #122 (override permissions par défaut), #131
(effort par agent/presets) et #132 (outil MCP d'édition du contexte projet)
sont verts en périmètre. Le sprint plugins multi-fichiers ESM / persistance
plugin-owned (#135/#136/#139) est co-implémenté dans les MÊMES fichiers de
câblage (frontend/src/ports/index.ts, backend/src/lib.rs, domain/ports.rs,
backend/dto.rs), inséparable sans staging interactif (indisponible ici).

Commit unique volontaire : préserve l'état vert QA sans découpe hunk risquée.
NON mergé vers develop tant que #137 (QA e2e plugins) n'est pas vert.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 <noreply@anthropic.com>

crates/application/src/skill/usecases.rs

@@ -30,6 +30,9 @@ pub struct CreateSkillInput {
     /// `None`/empty ⇒ the skill falls back to the first line of its body when
     /// surfaced (see [`domain::Skill::effective_description`]).
     pub description: Option<String>,
+    /// Capability nature to expose for this skill. Defaults to workflow when the
+    /// caller does not specify it.
+    pub kind: SkillKind,
     /// Initial Markdown body.
     pub content: String,
     /// Scope the skill is created in (selects its backing store).
@@ -67,7 +70,8 @@ impl CreateSkill {
         let id = SkillId::from_uuid(self.ids.new_uuid());
         let skill = Skill::new(id, input.name, MarkdownDoc::new(input.content), input.scope)
             .map_err(|e| AppError::Invalid(e.to_string()))?
-            .with_description(input.description);
+            .with_description(input.description)
+            .with_kind(input.kind);
         self.skills.save(&skill, &input.project_root).await?;
         Ok(CreateSkillOutput { skill })
     }